颈腰痛杂志
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中药学论文_基于网络药理学与分子对接的

文章目录

1 资料与方法

1.1 腰痛宁胶囊有效活性成分的筛选与作用靶点的获取

1.2 LDH疾病相关靶点的获取

1.3 腰痛宁胶囊治疗LDH潜在靶点的获取

1.4 蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)的构建与核心靶点的识别

1.5 基因本体论(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析

1.6“药物-成分-靶点”网络的构建

1.7 分子对接验证

2 结果

2.1 腰痛宁胶囊有效活性成分与作用靶点筛选结果

2.2 LDH的疾病相关靶点筛选结果

2.3 腰痛宁胶囊治疗LDH的潜在靶点

2.4 潜在靶点的PPI网络与核心靶点

2.5 GO与KEGG富集分析

2.6“药物-成分-靶点”网络

2.7 分子对接结果

3 讨论

文章摘要:目的 探讨腰痛宁胶囊治疗腰椎间盘突出症(LDH)的作用机制。方法 采用网络药理学方法,借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)、Genecards数据库与DisGeNET数据库筛选出腰痛宁胶囊有效活性成分及其作用靶点,获取LDH相关疾病靶点;绘制韦恩图并取得腰痛宁胶囊治疗LDH的潜在靶点后,使用STRING 11.5平台构建腰痛宁胶囊治疗LDH的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并使用Cytoscape 3.7. 2软件识别其主要功能子簇及其上的核心靶点;通过生物学信息注释数据库(DAVID)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)对核心靶点进行基因本体论(GO)与KEGG富集分析,通过Cytoscape 3.7. 2软件构建腰痛宁胶囊治疗LDH的“药物-成分-靶点”网络,运用Autodock4及Pymol 2.2. 0软件进行分子对接验证。结果 共筛选获得腰痛宁胶囊活性成分537个,作用靶点1335个,LDH相关疾病靶点812个,绘制韦恩图取交集获得潜在靶点155个;构建PPI网络后识别出主要功能子簇5个,包含43个核心靶点;GO富集分析显示核心靶点共涉及346个生物过程、30个细胞组成以及65个分子功能;KEGG富集分析显示核心靶点共涉及252条通路,并与其中磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B (PI3K-Akt)信号通路相关性较强;“药物-成分-靶点”网络显示腰痛宁胶囊共包含129种与治疗LDH直接相关的活性成分,分子对接验证显示,关键靶点白细胞介素8 (IL8)、基质金属蛋白酶1 (MMP1)、基质金属蛋白酶9(MMP9)与活性成分汉黄芩素、木犀草素、山柰酚、槲皮素结合能<-5 kcal/mol,显示出良好的结合能力。结论 腰痛宁胶囊治疗LDH的作用机制可能是通过汉黄芩素、木犀草素、山柰酚、槲皮素与IL8、MMP1、MMP9三个靶点的结合,抑制PI3K-Akt信号通路从而减轻机械痛阈值并缓解神经病理性疼痛实现。

文章关键词:

论文DOI:10.13288/j.11-2166/r.2022.16.013

论文分类号:R285.6